W naprotechnologii monitorujemy zmiany hormonów w cyklu, a dzięki obserwacjom możemy rozpoznać np. przedwczesną luteinizację komórek jajowych, hyperprolaktynemię, niedobory progesteronu w II fazie cyklu co może odpowiadać za pojawianie się torbieli czy poronień.
Kluczowym zagadnieniem do określenia problemów z płodnością jest dobrze zebrany wywiad, po którym określamy zakres badań, które warto wykonać. Naprotechnologia łączy ze sobą postępowanie z zakresu wielu dziedzin medycyny. Oprócz ginekologii i położnictwa bardzo ważna role odgrywa internista, diabetolog, dietetyk czy immunolog.